161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3938 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  100 
 
 
297 aa  614  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  98.32 
 
 
297 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  85.71 
 
 
294 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  81.48 
 
 
297 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  81.51 
 
 
295 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  82.19 
 
 
294 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  78.64 
 
 
296 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  59.79 
 
 
299 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  57.88 
 
 
299 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  59.04 
 
 
295 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  58.5 
 
 
299 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  56.66 
 
 
297 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  56.42 
 
 
296 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  56.31 
 
 
297 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  55.78 
 
 
300 aa  345  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  49.65 
 
 
296 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  49.3 
 
 
296 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  49.3 
 
 
295 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  50.36 
 
 
296 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  48.94 
 
 
348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  49.64 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  48.94 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  48.21 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  48.59 
 
 
295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  49.29 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  45.8 
 
 
293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  46.67 
 
 
289 aa  272  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  46.9 
 
 
288 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  45.7 
 
 
289 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  45.7 
 
 
289 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  45.7 
 
 
289 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  45.7 
 
 
289 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  45.77 
 
 
289 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  47.08 
 
 
294 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  45.64 
 
 
289 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  45.64 
 
 
289 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  50.19 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  42.05 
 
 
291 aa  251  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  45.26 
 
 
292 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  45.96 
 
 
300 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  45.26 
 
 
292 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  45.07 
 
 
289 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  44.14 
 
 
289 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  47.7 
 
 
291 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  44.14 
 
 
296 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  44.76 
 
 
292 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  45.96 
 
 
291 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  45.26 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  44.4 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  48.31 
 
 
259 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  45.26 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  43.14 
 
 
294 aa  242  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  44.63 
 
 
303 aa  242  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  43.14 
 
 
294 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  44.1 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  42.57 
 
 
298 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  43.49 
 
 
294 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  42.24 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  45.88 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  43.36 
 
 
318 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  43.51 
 
 
285 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  45.07 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  45.07 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  45.07 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  45.07 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  45.07 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  45.07 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  45.07 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  44.52 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  43.01 
 
 
291 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  41.38 
 
 
291 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  43.31 
 
 
296 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  43.55 
 
 
297 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  44.27 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  44.27 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  42.91 
 
 
303 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  41.87 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  41.87 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  43.99 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  41.87 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  40.57 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  40.57 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  40.21 
 
 
278 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  40.41 
 
 
292 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  39.93 
 
 
296 aa  208  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  40.27 
 
 
296 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1039  protein of unknown function DUF815  41.3 
 
 
296 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0079  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
254 aa  207  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.895882  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1227  hypothetical protein  42.69 
 
 
253 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0639  hypothetical protein  42.69 
 
 
253 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0395  protein of unknown function DUF815  42.31 
 
 
290 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.522501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  39.65 
 
 
292 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  39.93 
 
 
296 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2852  protein of unknown function DUF815  38.46 
 
 
299 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0924763 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1102  hypothetical protein  42.29 
 
 
253 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.83556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  39.22 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1807  hypothetical protein  42.25 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  normal  0.98572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  43.48 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  40.21 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  38.25 
 
 
298 aa  198  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>