161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2712 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  100 
 
 
294 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  97.96 
 
 
294 aa  593  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  93.52 
 
 
294 aa  567  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  89.35 
 
 
298 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  89.69 
 
 
303 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  76.06 
 
 
289 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  76.16 
 
 
289 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  75.09 
 
 
289 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  75.36 
 
 
296 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  75.8 
 
 
289 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  75.09 
 
 
289 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  75.09 
 
 
289 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  74.73 
 
 
289 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  74.38 
 
 
289 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  74.38 
 
 
289 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  75.8 
 
 
289 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  75.8 
 
 
289 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  75.8 
 
 
289 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  75.8 
 
 
289 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  75.8 
 
 
289 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  75.8 
 
 
289 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  75.8 
 
 
289 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  69.86 
 
 
285 aa  415  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  65.26 
 
 
293 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  65.14 
 
 
292 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  65.85 
 
 
291 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  64.38 
 
 
303 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  63.86 
 
 
292 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  63.86 
 
 
292 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  63.73 
 
 
291 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  63.41 
 
 
318 aa  363  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  64.21 
 
 
300 aa  362  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  65.02 
 
 
290 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  62.19 
 
 
310 aa  355  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  63.51 
 
 
291 aa  342  5.999999999999999e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  61.83 
 
 
296 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  59.36 
 
 
299 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  56.29 
 
 
288 aa  311  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  56.84 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  56.38 
 
 
290 aa  302  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  56.72 
 
 
294 aa  298  8e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  53.55 
 
 
291 aa  297  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  53.63 
 
 
323 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  53.63 
 
 
323 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  56.92 
 
 
325 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  53.31 
 
 
323 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  54.9 
 
 
284 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  50.17 
 
 
296 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  50.34 
 
 
296 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  50.17 
 
 
296 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  50.34 
 
 
295 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  50.67 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  50 
 
 
289 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  50.17 
 
 
295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  50.17 
 
 
348 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  48.68 
 
 
296 aa  269  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  49.66 
 
 
293 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  48.62 
 
 
300 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  49.14 
 
 
299 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  48.97 
 
 
295 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  48.97 
 
 
299 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  50.7 
 
 
296 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  47.81 
 
 
296 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  51.22 
 
 
280 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  48.3 
 
 
299 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  48.8 
 
 
297 aa  254  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  48.45 
 
 
297 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  46.92 
 
 
295 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  45.55 
 
 
297 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  44.52 
 
 
294 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1719  hypothetical protein  44.44 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  43.49 
 
 
297 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  44.52 
 
 
296 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  49.03 
 
 
259 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  42.47 
 
 
297 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  43.15 
 
 
294 aa  235  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  46.23 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1807  hypothetical protein  47.48 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  normal  0.98572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  44.86 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  44.56 
 
 
278 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1540  hypothetical protein  42.48 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  47.57 
 
 
297 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  55.65 
 
 
287 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  55.65 
 
 
287 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  46.47 
 
 
320 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  45.91 
 
 
296 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  45.52 
 
 
297 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  46.62 
 
 
324 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  43.16 
 
 
279 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  46.74 
 
 
325 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  43.16 
 
 
279 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  42.71 
 
 
292 aa  224  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  47.15 
 
 
323 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  42.57 
 
 
292 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  43.4 
 
 
298 aa  222  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  45.17 
 
 
291 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  44.1 
 
 
280 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  42.91 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2338  hypothetical protein  41.72 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>