195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2054 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  63.86 
 
 
297 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  63.51 
 
 
292 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  57.5 
 
 
296 aa  324  9e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  48.58 
 
 
296 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  48.57 
 
 
293 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  48.92 
 
 
296 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  46.64 
 
 
291 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  48.56 
 
 
296 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  48.3 
 
 
294 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  49.12 
 
 
290 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  45.05 
 
 
292 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  47.46 
 
 
291 aa  245  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  45.36 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  48.55 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  47.43 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  45 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  47.25 
 
 
279 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  47.25 
 
 
279 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  44.67 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  44.67 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  49.61 
 
 
296 aa  242  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  45.02 
 
 
300 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  46.79 
 
 
296 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  44.48 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  47.89 
 
 
289 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  44.9 
 
 
298 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2937  protein of unknown function DUF815  45.26 
 
 
485 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000616511  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  45.36 
 
 
295 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  45.36 
 
 
348 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  46.07 
 
 
295 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  45.55 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  47.89 
 
 
289 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  44.41 
 
 
299 aa  235  8e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  43.79 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  44.21 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1494  protein of unknown function DUF815  44.18 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  45.26 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  46.21 
 
 
294 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  44.33 
 
 
293 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  47.18 
 
 
289 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  47.18 
 
 
289 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  47.18 
 
 
289 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  49.37 
 
 
291 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  44.01 
 
 
325 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  43.69 
 
 
300 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  43.75 
 
 
294 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  44.41 
 
 
325 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  44.06 
 
 
329 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  45.55 
 
 
310 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  46.83 
 
 
296 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  43.9 
 
 
294 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  44.93 
 
 
283 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  44.52 
 
 
307 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2661  hypothetical protein  44.68 
 
 
288 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0930864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  44.25 
 
 
295 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  47.18 
 
 
289 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  47.18 
 
 
289 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  46.57 
 
 
296 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  46.48 
 
 
289 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  46.01 
 
 
280 aa  228  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  46.15 
 
 
303 aa  228  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  45.17 
 
 
298 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3290  protein of unknown function DUF815  43.3 
 
 
423 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1692  protein of unknown function DUF815  43.2 
 
 
290 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  45.52 
 
 
294 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  45.68 
 
 
289 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  44.6 
 
 
284 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  47.52 
 
 
288 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  45.64 
 
 
292 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  45.42 
 
 
285 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  44.37 
 
 
290 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  45.17 
 
 
294 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1080  protein of unknown function DUF815  45.1 
 
 
451 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  44.91 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  48.83 
 
 
287 aa  225  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  48.83 
 
 
287 aa  225  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2338  hypothetical protein  43.97 
 
 
287 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  46.18 
 
 
303 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  46.04 
 
 
296 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  47.58 
 
 
259 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  43.55 
 
 
297 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  44.56 
 
 
297 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  46.04 
 
 
296 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1109  hypothetical protein  44.98 
 
 
435 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  43.66 
 
 
296 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  43.4 
 
 
323 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  44.29 
 
 
323 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  44.29 
 
 
323 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  44.21 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2796  protein of unknown function DUF815  42.12 
 
 
428 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4062  hypothetical protein  39.35 
 
 
435 aa  222  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>