160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2123 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  56.06 
 
 
291 aa  340  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  58.68 
 
 
290 aa  338  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  57.09 
 
 
299 aa  335  5e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  56.7 
 
 
300 aa  335  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  56.36 
 
 
291 aa  332  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  58.45 
 
 
289 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  57.04 
 
 
292 aa  332  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  57.24 
 
 
292 aa  332  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  55.67 
 
 
292 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  58.19 
 
 
291 aa  329  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  55.67 
 
 
293 aa  329  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  56.69 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  56.69 
 
 
289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  57.04 
 
 
289 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  57.04 
 
 
289 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  53.63 
 
 
291 aa  325  5e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  57.39 
 
 
289 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  57.75 
 
 
289 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  57.39 
 
 
289 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  57.39 
 
 
289 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  57.39 
 
 
289 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  55.67 
 
 
291 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  57.92 
 
 
296 aa  322  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  54.39 
 
 
303 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  56.79 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  56.6 
 
 
290 aa  318  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  58.04 
 
 
289 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  58.04 
 
 
289 aa  318  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  58.04 
 
 
289 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  58.04 
 
 
289 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  58.04 
 
 
289 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  58.04 
 
 
289 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  58.04 
 
 
289 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  55.21 
 
 
318 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  54.45 
 
 
310 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  57.4 
 
 
294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  57.04 
 
 
294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  56.68 
 
 
294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  54.74 
 
 
288 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  55.4 
 
 
303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  55.76 
 
 
285 aa  302  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  51.72 
 
 
293 aa  295  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  49.66 
 
 
296 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  49.64 
 
 
289 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  48.97 
 
 
296 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  48.29 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  50.34 
 
 
348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  50.34 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  48.97 
 
 
295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  47.37 
 
 
299 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  49.82 
 
 
296 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  50.18 
 
 
297 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  48.79 
 
 
299 aa  279  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  49.31 
 
 
295 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  48.45 
 
 
296 aa  278  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  48.76 
 
 
300 aa  278  8e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  49.82 
 
 
297 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  48.28 
 
 
296 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  47.93 
 
 
296 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  48.6 
 
 
295 aa  276  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  48.28 
 
 
296 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  49.13 
 
 
299 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  49.82 
 
 
284 aa  272  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  48.45 
 
 
297 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  48.63 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  50.35 
 
 
325 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  46.21 
 
 
294 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  46.74 
 
 
297 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  46.71 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  48.11 
 
 
295 aa  265  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  46.05 
 
 
297 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  47.9 
 
 
323 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  47.26 
 
 
292 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  47.55 
 
 
323 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  47.55 
 
 
323 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  53.03 
 
 
287 aa  258  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  47.55 
 
 
280 aa  258  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  53.03 
 
 
287 aa  258  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  50.19 
 
 
259 aa  258  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  45.64 
 
 
296 aa  254  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  47.22 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  46.69 
 
 
297 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2734  hypothetical protein  49.21 
 
 
335 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333936  normal  0.444885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1212  hypothetical protein  45.77 
 
 
287 aa  248  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  48.44 
 
 
325 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  46.43 
 
 
320 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1039  protein of unknown function DUF815  47.57 
 
 
296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2661  hypothetical protein  43.45 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0930864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  46.1 
 
 
296 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  43.49 
 
 
292 aa  242  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  44.96 
 
 
279 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1692  protein of unknown function DUF815  42.81 
 
 
290 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  48.05 
 
 
323 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  44.96 
 
 
279 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  48.58 
 
 
329 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  48.25 
 
 
306 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  45 
 
 
291 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1494  protein of unknown function DUF815  42.37 
 
 
290 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  45.96 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>