163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1485 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  95.93 
 
 		 295 aa  577  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  94.58 
 
 		 348 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  94.58 
 
 		 295 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  90.17 
 
 		 296 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  85.08 
 
 		 296 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  85.37 
 
 		 296 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  81.02 
 
 		 296 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  81.36 
 
 		 296 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  79.45 
 
 		 293 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  80.34 
 
 		 296 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  56.84 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  52.19 
 
 		 299 aa  308  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  51.85 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  50.53 
 
 		 299 aa  298  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  52.07 
 
 		 296 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  51.05 
 
 		 299 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  52.07 
 
 		 297 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  51.72 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  49.83 
 
 		 295 aa  295  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  52.1 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  51.37 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  49.65 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  51.22 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  51.4 
 
 		 289 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  51.4 
 
 		 289 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  51.75 
 
 		 289 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  49.31 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  51.05 
 
 		 289 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  51.4 
 
 		 289 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  51.4 
 
 		 289 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  52.08 
 
 		 289 aa  288  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  51.4 
 
 		 289 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  51.4 
 
 		 289 aa  288  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  51.43 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  48.97 
 
 		 293 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  54.67 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  48.62 
 
 		 291 aa  285  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  47.95 
 
 		 292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  49.64 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  48.59 
 
 		 297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  47.93 
 
 		 292 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  51.71 
 
 		 288 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  52.1 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  52.1 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  52.1 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  52.1 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  52.1 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  52.1 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  52.1 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  50 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  47.89 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  51.06 
 
 		 294 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  49.48 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  48.23 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  48.58 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  50.34 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  50.34 
 
 		 294 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  48.45 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  49.33 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  47.44 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  47.26 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  48.97 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  49.13 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  50.56 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  47.59 
 
 		 290 aa  268  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  49.47 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  49.62 
 
 		 296 aa  265  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  48.62 
 
 		 291 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  51.24 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  51.35 
 
 		 259 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  49.81 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  47.5 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  47.69 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  48.69 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  48.69 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  46.81 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  47.33 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  45.26 
 
 		 280 aa  238  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1540  hypothetical protein  44.76 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1719  hypothetical protein  45.8 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  45.55 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  48.9 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  48.9 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  47.52 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1807  hypothetical protein  45.99 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  normal  0.98572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1039  protein of unknown function DUF815  44.36 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0079  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.895882  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0639  hypothetical protein  43.87 
 
 		 253 aa  219  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486807  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1227  hypothetical protein  43.48 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  42.96 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  45.17 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1102  hypothetical protein  43.48 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.83556  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  43.26 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  43.26 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  43.64 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  41.55 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  45.28 
 
 		 325 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  44.87 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  44.53 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>