161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1719 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1540  hypothetical protein  94.75 
 
 
328 aa  643    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1719  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  672    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1807  hypothetical protein  68.39 
 
 
296 aa  411  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  normal  0.98572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  45.55 
 
 
296 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  45.1 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  45.21 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  48 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  42.96 
 
 
291 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  45.73 
 
 
289 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  45.88 
 
 
296 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  44.44 
 
 
294 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  43.79 
 
 
298 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  45.88 
 
 
296 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  46.1 
 
 
289 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  44.12 
 
 
294 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  46.1 
 
 
289 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  46.55 
 
 
296 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  45.8 
 
 
295 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  46.79 
 
 
291 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  45.82 
 
 
295 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  45.74 
 
 
289 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  45.74 
 
 
296 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  45.45 
 
 
348 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  45.52 
 
 
289 aa  235  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  45.52 
 
 
289 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  46.23 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  46.38 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  46.38 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  45.88 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  45.88 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  45.88 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  46.38 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  46.38 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  46.38 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  46.38 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  46.38 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  45.45 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  46.97 
 
 
290 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  42.86 
 
 
288 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  44.37 
 
 
294 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  44.09 
 
 
293 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  44.44 
 
 
292 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  44.44 
 
 
292 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  45.16 
 
 
291 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  40.93 
 
 
323 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  40.93 
 
 
323 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  40.59 
 
 
285 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  40.21 
 
 
325 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  41.64 
 
 
323 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  42.3 
 
 
303 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  40.55 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  42.91 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  44.12 
 
 
300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  43.68 
 
 
289 aa  219  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  43.31 
 
 
303 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  41.5 
 
 
292 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  43.7 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  43.7 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  41.85 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  43.12 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  42.22 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  41.5 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  40.13 
 
 
296 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  42.6 
 
 
291 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  40.96 
 
 
299 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  41.11 
 
 
299 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  39.94 
 
 
297 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  43.45 
 
 
310 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  41.03 
 
 
300 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  41.32 
 
 
297 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  40.29 
 
 
295 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  40.07 
 
 
297 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  40.37 
 
 
295 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  41.04 
 
 
290 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  39.78 
 
 
294 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  39.85 
 
 
299 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  40.89 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  39.01 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  40.15 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  40.52 
 
 
297 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  40.15 
 
 
296 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  40.67 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  40 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1212  hypothetical protein  38.8 
 
 
287 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1080  protein of unknown function DUF815  40.43 
 
 
451 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  39.93 
 
 
297 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3290  protein of unknown function DUF815  39.93 
 
 
423 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  39.54 
 
 
291 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  38.1 
 
 
323 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  38.04 
 
 
325 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  36.97 
 
 
296 aa  189  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  43.53 
 
 
259 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  35.58 
 
 
296 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  39.55 
 
 
320 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  38.14 
 
 
296 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  36.75 
 
 
298 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  37.98 
 
 
279 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  37.98 
 
 
279 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  35.46 
 
 
296 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  38.32 
 
 
329 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>