165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0091 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0091  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  820    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1080  protein of unknown function DUF815  44.42 
 
 
451 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0393  hypothetical protein  43.03 
 
 
448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.467349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4062  hypothetical protein  40.28 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2937  protein of unknown function DUF815  39.45 
 
 
485 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000616511  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3290  protein of unknown function DUF815  38.57 
 
 
423 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0255  ATPase  43.12 
 
 
426 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2317  hypothetical protein  44.92 
 
 
474 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0244932  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3304  protein of unknown function DUF815  37 
 
 
428 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2796  protein of unknown function DUF815  37 
 
 
428 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1109  hypothetical protein  38.61 
 
 
435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0284  hypothetical protein  38.22 
 
 
452 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15640  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  38.46 
 
 
436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3284  protein of unknown function DUF815  39.08 
 
 
459 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2854  hypothetical protein  36.08 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0399662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1386  hypothetical protein  37.59 
 
 
442 aa  272  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.187879  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1700  hypothetical protein  32.96 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0212  hypothetical protein  34.78 
 
 
465 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1586  protein of unknown function DUF815  45.74 
 
 
440 aa  256  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0900  hypothetical protein  34.79 
 
 
465 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3420  protein of unknown function DUF815  36.78 
 
 
429 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1275  hypothetical protein  34.26 
 
 
438 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  46.51 
 
 
296 aa  227  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  48.98 
 
 
292 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  44.88 
 
 
296 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  48.99 
 
 
297 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  45.34 
 
 
297 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2014  protein of unknown function DUF815  27.86 
 
 
392 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  44.66 
 
 
294 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  44.94 
 
 
296 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1731  protein of unknown function DUF815  49.8 
 
 
357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  43.17 
 
 
295 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0639  hypothetical protein  42.37 
 
 
253 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486807  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1465  protein of unknown function DUF815  39.33 
 
 
273 aa  193  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000978175  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1438  hypothetical protein  48.21 
 
 
354 aa  192  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416063  normal  0.735551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  45.76 
 
 
297 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  45.34 
 
 
297 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  39.78 
 
 
299 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1102  hypothetical protein  42.37 
 
 
253 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.83556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  44.13 
 
 
296 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  39.78 
 
 
295 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  43.57 
 
 
291 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  46.67 
 
 
296 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  46.67 
 
 
295 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  41.95 
 
 
294 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1227  hypothetical protein  41.53 
 
 
253 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  41.57 
 
 
297 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  43.72 
 
 
259 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  47.11 
 
 
295 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  45.38 
 
 
296 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  41.99 
 
 
292 aa  186  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  44.8 
 
 
293 aa  186  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  40.52 
 
 
297 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  45.33 
 
 
296 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  46.67 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  44.98 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  41.99 
 
 
292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  47.71 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  42.55 
 
 
287 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  43.45 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  42.55 
 
 
287 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  46.22 
 
 
348 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  40.52 
 
 
297 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  46.22 
 
 
295 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  40.07 
 
 
294 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  43.65 
 
 
292 aa  183  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  43.78 
 
 
284 aa  183  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  44.4 
 
 
290 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  37 
 
 
299 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  44.72 
 
 
279 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1766  hypothetical protein  44.05 
 
 
296 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  44.72 
 
 
279 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  43.02 
 
 
294 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  42.25 
 
 
294 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  43.02 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  43.02 
 
 
294 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  43.95 
 
 
288 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  42.65 
 
 
303 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  40.94 
 
 
291 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  44.58 
 
 
291 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  41.91 
 
 
299 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  41.42 
 
 
325 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  40 
 
 
296 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  39.78 
 
 
293 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  45.81 
 
 
278 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0715  ABC transporter ATPase  41.35 
 
 
254 aa  178  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0689546  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  43.43 
 
 
298 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  41.15 
 
 
300 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  40.36 
 
 
300 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  43.37 
 
 
320 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  44.22 
 
 
292 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  39.7 
 
 
299 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  42.51 
 
 
329 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  43.39 
 
 
291 aa  176  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  44.44 
 
 
289 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  42.46 
 
 
285 aa  176  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  42.97 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  43.46 
 
 
290 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3034  hypothetical protein  41.94 
 
 
304 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2734  hypothetical protein  42.68 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333936  normal  0.444885 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>