160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3034 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3034  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  622  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  72.07 
 
 		 292 aa  421  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0889  hypothetical protein  69.34 
 
 		 288 aa  411  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0885  hypothetical protein  69.34 
 
 		 288 aa  411  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  70.97 
 
 		 298 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2338  hypothetical protein  70.07 
 
 		 287 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  70.82 
 
 		 329 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  69.18 
 
 		 279 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  70 
 
 		 325 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  69.18 
 
 		 279 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  72.37 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1494  protein of unknown function DUF815  65.62 
 
 		 290 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  68.73 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  68.35 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  65.94 
 
 		 291 aa  384  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2852  protein of unknown function DUF815  69.04 
 
 		 299 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0924763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  65.74 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  69.31 
 
 		 296 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1692  protein of unknown function DUF815  64.93 
 
 		 290 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  71.1 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  66.91 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  64.85 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  68.73 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  64.51 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2285  hypothetical protein  67.5 
 
 		 291 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2734  hypothetical protein  67.74 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333936  normal  0.444885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2661  hypothetical protein  67.53 
 
 		 288 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0930864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2186  protein of unknown function DUF815  67.14 
 
 		 295 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1212  hypothetical protein  63.64 
 
 		 287 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  71.98 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  64.77 
 
 		 283 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1766  hypothetical protein  64.64 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1183  hypothetical protein  65.71 
 
 		 289 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  67.51 
 
 		 280 aa  361  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0395  protein of unknown function DUF815  64.16 
 
 		 290 aa  355  7.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.522501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  48.04 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  47.14 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  44.04 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  47 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  45.49 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  43.86 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  44.79 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  43.6 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0128  hypothetical protein  44.13 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.356895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  43.94 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  41.46 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  44.29 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  42.51 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  42.91 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  42.71 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  42.25 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  42.25 
 
 		 289 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  42.16 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  42.16 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  43.16 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  43.16 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  42.16 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  43.16 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  43.16 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  43.16 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  43.16 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  43.16 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3110  hypothetical protein  46.01 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957774  normal  0.183522 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  43.01 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  41.5 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  43.1 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  42.32 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  41.5 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  41.81 
 
 		 289 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  41.81 
 
 		 289 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  44.24 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  43.4 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  45.45 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  43.84 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  44.36 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  42.33 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  45.77 
 
 		 296 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  45.45 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  44.24 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  45.49 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  42.29 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  42.76 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  44.91 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  42.76 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  41.28 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  44.91 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  42.81 
 
 		 323 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3442  hypothetical protein  44.06 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21771  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  45.58 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  45.23 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  46.47 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  44.86 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  44.25 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  43.36 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  43.31 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  45.39 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  43.01 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  43.31 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  43.31 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  40.43 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>