230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04829 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04829  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001090  fOG: TPR repeat protein SEL1 subfamily  82.03 
 
 		 398 aa  673    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0215  hypothetical protein  53.67 
 
 		 385 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.613438  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1095  hypothetical protein  43.15 
 
 		 387 aa  270  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0028  hypothetical protein  43.15 
 
 		 387 aa  270  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.44 
 
 		 789 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.72 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.11 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 1032 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.35 
 
 		 684 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.58 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  28.38 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  27.01 
 
 		 552 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1037 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1402 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  28.51 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  26.05 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  28.16 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  28.16 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.31 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.72 
 
 		 961 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  27.73 
 
 		 831 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.21 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  26.42 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  24.91 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  26.01 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1002 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  25.86 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.03 
 
 		 278 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  26.56 
 
 		 557 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  27.95 
 
 		 978 aa  61.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.75 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1059 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.15 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.52 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.2 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 976 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 942 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  26.1 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  25.6 
 
 		 765 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  25.1 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  30.32 
 
 		 1910 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  25.7 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  25.1 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  25.1 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.25 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.4 
 
 		 232 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  26.77 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  25.1 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.49 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1877 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  26.1 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.1 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  26.7 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  24.55 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.43 
 
 		 2413 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  26.27 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.94 
 
 		 865 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.31 
 
 		 890 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  30.67 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  28.21 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  29.41 
 
 		 258 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1493 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.74 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  21.78 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  29.01 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  29.41 
 
 		 255 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  25.89 
 
 		 523 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  29.41 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  30.25 
 
 		 536 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  23.3 
 
 		 838 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  26.19 
 
 		 245 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  25.86 
 
 		 235 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.15 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 		 1430 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 		 599 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  30.91 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  23.35 
 
 		 344 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  28.73 
 
 		 229 aa  53.9  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  28.21 
 
 		 913 aa  53.5  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  24.86 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  24.59 
 
 		 241 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  31.48 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  31.68 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2296  Sel1 domain-containing protein  29.09 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  24.86 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5053  Sel1 domain-containing protein  28 
 
 		 265 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  31.01 
 
 		 1105 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  28.1 
 
 		 233 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.5 
 
 		 222 aa  53.1  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 1261 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  25.43 
 
 		 331 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 		 860 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 1196 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>