246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0028 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0028  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  796    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1095  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  796    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001090  fOG: TPR repeat protein SEL1 subfamily  41.79 
 
 		 398 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04829  hypothetical protein  43.2 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0215  hypothetical protein  40.72 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.613438  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.17 
 
 		 278 aa  86.3  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.12 
 
 		 684 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.93 
 
 		 528 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30.62 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  35.38 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  27.59 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 976 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.73 
 
 		 789 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 831 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.14 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  25.61 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1402 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.73 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.84 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  28.05 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  28.86 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.81 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.9 
 
 		 961 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  28.08 
 
 		 679 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.59 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.4 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  29.48 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.26 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.06 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1493 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2413 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  36.44 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  27.46 
 
 		 838 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  31.58 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  33.61 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.25 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  31.97 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.91 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  29.91 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  31.97 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  31.97 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  31.97 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  27.82 
 
 		 557 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.25 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  31.19 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  30.37 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.8 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2060  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1002 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  28.08 
 
 		 680 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  27.78 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 865 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  26.94 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  26.94 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.74 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  26.94 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  28.81 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  27.45 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 252 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1032 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.81 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1037 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.65 
 
 		 890 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.48 
 
 		 552 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.82 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  29.44 
 
 		 285 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  23.57 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  33.55 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.52 
 
 		 685 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  26.52 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  27.03 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  28.64 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  29.17 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  34.39 
 
 		 731 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2792  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  27.27 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  30.65 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  31.32 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.61 
 
 		 839 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.43 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  29.61 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  30.65 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  30.65 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  30.65 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  25.44 
 
 		 1044 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.86 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  25.44 
 
 		 1078 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.12 
 
 		 1263 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  29.84 
 
 		 258 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  26.57 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.88 
 
 		 211 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.65 
 
 		 811 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.36 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>