More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03608 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03608  succinate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 478 aa  979    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002442  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  81.17 
 
 		 478 aa  805    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0223747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.34 
 
 		 479 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.34 
 
 		 479 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.68 
 
 		 480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.86 
 
 		 480 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2603  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.7 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.61 
 
 		 483 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.39 
 
 		 483 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1888  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.83 
 
 		 485 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000160423  normal  0.0242248 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.86 
 
 		 489 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3173  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.39 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.38 
 
 		 480 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.72 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.38 
 
 		 480 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.31 
 
 		 496 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.1 
 
 		 488 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.83 
 
 		 483 aa  505  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.28 
 
 		 493 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.38 
 
 		 480 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.74 
 
 		 509 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.2 
 
 		 486 aa  501  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3929  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.13 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.09 
 
 		 481 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.98 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3863  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 485 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  49.79 
 
 		 482 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.5 
 
 		 489 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.08 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.86 
 
 		 483 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.54 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.3 
 
 		 490 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.55 
 
 		 480 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.97 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.77 
 
 		 493 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.75 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.21 
 
 		 480 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.64 
 
 		 486 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.72 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.64 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.75 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  50.75 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 		 482 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.75 
 
 		 493 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0134  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.4 
 
 		 495 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.75 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  50.75 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.11 
 
 		 490 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.54 
 
 		 482 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.52 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.95 
 
 		 499 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.55 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2023  succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.08 
 
 		 490 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.491893  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 493 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.11 
 
 		 480 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.33 
 
 		 485 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.84 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.95 
 
 		 499 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.06 
 
 		 482 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.57 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.33 
 
 		 491 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.55 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2636  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.22 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 486 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.55 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.09 
 
 		 482 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0407  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.2 
 
 		 475 aa  491  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.09 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 492 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.55 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  52.84 
 
 		 491 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.74 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.33 
 
 		 502 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.31 
 
 		 490 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.09 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.53 
 
 		 482 aa  488  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.33 
 
 		 485 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1290  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.11 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.72 
 
 		 490 aa  488  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.09 
 
 		 482 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.02 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 489 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1533  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.29 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 489 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.21 
 
 		 488 aa  482  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 489 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.08 
 
 		 500 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 489 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.46 
 
 		 489 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.44 
 
 		 489 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.7 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.88 
 
 		 489 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42872  predicted protein  51.87 
 
 		 503 aa  484  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.701812 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2373  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.83 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183716  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.64 
 
 		 486 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4969  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.21 
 
 		 482 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506966  normal  0.048465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>