More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001761 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  79.9 
 
 		 388 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.32 
 
 		 388 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  88.4 
 
 		 388 aa  709    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.58 
 
 		 388 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  79.9 
 
 		 397 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.8 
 
 		 388 aa  637    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  80.93 
 
 		 388 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  79.12 
 
 		 388 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  80.15 
 
 		 388 aa  648    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  81.96 
 
 		 388 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  792    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  76.8 
 
 		 388 aa  630  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  76.8 
 
 		 388 aa  631  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.8 
 
 		 388 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.55 
 
 		 388 aa  627  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.29 
 
 		 388 aa  628  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.55 
 
 		 388 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  76.8 
 
 		 388 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  75.77 
 
 		 388 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  75.77 
 
 		 388 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  75.52 
 
 		 388 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  75.77 
 
 		 388 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  74.48 
 
 		 388 aa  620  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  75.52 
 
 		 389 aa  623  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  75.97 
 
 		 391 aa  617  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75 
 
 		 388 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  76.23 
 
 		 395 aa  616  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  74.48 
 
 		 388 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.85 
 
 		 390 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  75 
 
 		 388 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  73.2 
 
 		 388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.68 
 
 		 389 aa  598  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.71 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.16 
 
 		 389 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  70.88 
 
 		 387 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  70.1 
 
 		 389 aa  589  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.62 
 
 		 387 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  71.91 
 
 		 388 aa  584  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  71.91 
 
 		 388 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.1 
 
 		 387 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.85 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.85 
 
 		 387 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.07 
 
 		 409 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.56 
 
 		 409 aa  564  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.04 
 
 		 397 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  68.81 
 
 		 409 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  67.53 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.65 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  62.56 
 
 		 389 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.18 
 
 		 391 aa  512  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  59.95 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  59.56 
 
 		 491 aa  489  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.31 
 
 		 388 aa  484  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.57 
 
 		 372 aa  433  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  52.41 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.61 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  49.61 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  49.61 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.57 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.23 
 
 		 442 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  31.82 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  31.72 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  32.59 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  31.85 
 
 		 439 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  32.68 
 
 		 457 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  32.3 
 
 		 449 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.21 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.64 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0911  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.4 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1104  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.4 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.08 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  29.72 
 
 		 466 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  31.93 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  31.44 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1210  nucleotide sugar dehydrogenase  32.41 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.09 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  31.04 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.47 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  32.21 
 
 		 427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.84 
 
 		 471 aa  166  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.75 
 
 		 449 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30 
 
 		 450 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  30.16 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.89 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.16 
 
 		 467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.26 
 
 		 478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.39 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  30.05 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  30.65 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.99 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.54 
 
 		 434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.79 
 
 		 447 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.75 
 
 		 467 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  29.86 
 
 		 443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  30.05 
 
 		 448 aa  162  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  31.32 
 
 		 475 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.52 
 
 		 448 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  32.31 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>