More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1067 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 391 aa  790    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.3 
 
 		 388 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  65.3 
 
 		 388 aa  543  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  65.3 
 
 		 388 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  65.55 
 
 		 388 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.3 
 
 		 388 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.55 
 
 		 388 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.3 
 
 		 388 aa  542  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.55 
 
 		 388 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  65.3 
 
 		 388 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  65.3 
 
 		 388 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  65.3 
 
 		 388 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  65.04 
 
 		 388 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.78 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  65.3 
 
 		 389 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.07 
 
 		 388 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  66.07 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.04 
 
 		 388 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  66.32 
 
 		 389 aa  535  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.27 
 
 		 388 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  62.98 
 
 		 388 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64.52 
 
 		 388 aa  524  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.68 
 
 		 390 aa  523  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  63.59 
 
 		 395 aa  521  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.24 
 
 		 389 aa  518  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.59 
 
 		 391 aa  518  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  62.4 
 
 		 389 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  63.5 
 
 		 388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  62.98 
 
 		 388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.89 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  61.18 
 
 		 388 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.14 
 
 		 409 aa  511  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  63.24 
 
 		 388 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.5 
 
 		 387 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.66 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.7 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  63.24 
 
 		 387 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  61.18 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.44 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  62.89 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  61.95 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.41 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.14 
 
 		 387 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  62.37 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  62.47 
 
 		 389 aa  504  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  61.7 
 
 		 388 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  61.18 
 
 		 388 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  60.41 
 
 		 388 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.61 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  59.61 
 
 		 491 aa  484  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.1 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.88 
 
 		 398 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  58.29 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.58 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.94 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  50.5 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  43.85 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  43.85 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.85 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.81 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  32.5 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  32.5 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  32.03 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.11 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  31.86 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.96 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  34.18 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.81 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.99 
 
 		 451 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.24 
 
 		 425 aa  179  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.79 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  33.05 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  32.2 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  31.27 
 
 		 473 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.7 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  33.14 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3605  nucleotide sugar dehydrogenase  31.68 
 
 		 441 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0620  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.62 
 
 		 435 aa  172  9e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0934466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.28 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  28.68 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  30.64 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.18 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.01 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  32.87 
 
 		 443 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.33 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.52 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.31 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  32.11 
 
 		 437 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.18 
 
 		 460 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  30.53 
 
 		 458 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.82 
 
 		 471 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.56 
 
 		 443 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  31.25 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.56 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  29.86 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  27.7 
 
 		 457 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.39 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  29.97 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  29.97 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>