More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1203 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  83.51 
 
 		 388 aa  679    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  83.51 
 
 		 388 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  82.73 
 
 		 388 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  83.25 
 
 		 388 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  76.55 
 
 		 389 aa  635    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  76.8 
 
 		 388 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  82.73 
 
 		 388 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  82.47 
 
 		 388 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  82.99 
 
 		 388 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  83.25 
 
 		 388 aa  678    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  82.47 
 
 		 388 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  791    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  90.72 
 
 		 388 aa  728    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  89.95 
 
 		 388 aa  717    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  83.51 
 
 		 388 aa  679    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  82.73 
 
 		 388 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  78.87 
 
 		 388 aa  647    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  83.76 
 
 		 388 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.26 
 
 		 388 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  76.29 
 
 		 388 aa  627  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  75.19 
 
 		 395 aa  619  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.71 
 
 		 388 aa  617  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  73.71 
 
 		 397 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.74 
 
 		 388 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.26 
 
 		 388 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  70.88 
 
 		 388 aa  608  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  73.45 
 
 		 388 aa  604  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  73.2 
 
 		 388 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  72.68 
 
 		 389 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.2 
 
 		 389 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.87 
 
 		 391 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.2 
 
 		 389 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  71.91 
 
 		 388 aa  591  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.36 
 
 		 388 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  71.65 
 
 		 388 aa  587  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.51 
 
 		 390 aa  580  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.81 
 
 		 387 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.36 
 
 		 388 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.07 
 
 		 387 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.3 
 
 		 409 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  69.33 
 
 		 387 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.59 
 
 		 387 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.07 
 
 		 387 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.3 
 
 		 409 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  68.3 
 
 		 409 aa  568  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.49 
 
 		 397 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  65.98 
 
 		 388 aa  548  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.06 
 
 		 398 aa  544  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  65.9 
 
 		 389 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.07 
 
 		 391 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  60.45 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  62.01 
 
 		 491 aa  509  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.99 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.11 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  53.16 
 
 		 422 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.3 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  47.3 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  47.3 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  32.53 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.2 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  32.45 
 
 		 473 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.79 
 
 		 442 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  31.93 
 
 		 457 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  31.32 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.2 
 
 		 467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.87 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.66 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  31.37 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  33.97 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  30.6 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.87 
 
 		 457 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  32.7 
 
 		 439 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  30.29 
 
 		 475 aa  170  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  33.06 
 
 		 450 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  33.52 
 
 		 438 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  31.65 
 
 		 427 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  31.77 
 
 		 442 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  33.52 
 
 		 438 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  31.39 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  33.7 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.39 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  32.6 
 
 		 437 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.62 
 
 		 448 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.11 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.59 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.44 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  32.6 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  32.61 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.08 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  31.17 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.52 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  31.49 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  31.17 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.62 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.62 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  32.97 
 
 		 434 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.52 
 
 		 437 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>