More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0591 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  79.9 
 
 		 388 aa  647    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  792    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  78.35 
 
 		 388 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.84 
 
 		 388 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.52 
 
 		 388 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  76.49 
 
 		 391 aa  625  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.03 
 
 		 388 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  74.48 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  75 
 
 		 388 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  74.48 
 
 		 389 aa  610  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  610  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.94 
 
 		 388 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  73.45 
 
 		 388 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  71.39 
 
 		 388 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.16 
 
 		 389 aa  594  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  71.83 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  71.39 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  71.65 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  71.03 
 
 		 390 aa  592  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  71.65 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  72.42 
 
 		 388 aa  593  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  71.65 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.36 
 
 		 388 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  70.88 
 
 		 388 aa  584  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.1 
 
 		 389 aa  587  1e-166  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.62 
 
 		 388 aa  586  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.88 
 
 		 388 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.88 
 
 		 388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  70.88 
 
 		 388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.62 
 
 		 388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  70.36 
 
 		 388 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.62 
 
 		 388 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  70.88 
 
 		 388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.36 
 
 		 388 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.13 
 
 		 388 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  68.3 
 
 		 389 aa  568  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  69.59 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  69.07 
 
 		 388 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  67.53 
 
 		 387 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  67.53 
 
 		 387 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.24 
 
 		 397 aa  555  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  66.75 
 
 		 387 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  66.75 
 
 		 387 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.98 
 
 		 387 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.46 
 
 		 409 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.46 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  65.72 
 
 		 409 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  63.4 
 
 		 388 aa  529  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.69 
 
 		 398 aa  521  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  60.26 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  59.31 
 
 		 491 aa  486  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.1 
 
 		 391 aa  480  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  55.67 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.44 
 
 		 388 aa  458  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  52.15 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.23 
 
 		 372 aa  423  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.3 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  47.3 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  47.3 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.87 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.65 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  32.1 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  34.27 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  31.22 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.71 
 
 		 467 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  30.65 
 
 		 467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  29.03 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  32.69 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.01 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.56 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  31.37 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.58 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.77 
 
 		 436 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  31.37 
 
 		 437 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.87 
 
 		 437 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.37 
 
 		 460 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.3 
 
 		 457 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  30.08 
 
 		 470 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  31.11 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.08 
 
 		 470 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.04 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.81 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  33.88 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  30.16 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  30.08 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.81 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.16 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.16 
 
 		 473 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.08 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.08 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  32.97 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  33.52 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  30.38 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  30.14 
 
 		 482 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.29 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  29.81 
 
 		 470 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.78 
 
 		 457 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>