More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3483 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 		 389 aa  792    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.56 
 
 		 390 aa  604  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  73.97 
 
 		 388 aa  599  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.47 
 
 		 389 aa  598  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.16 
 
 		 388 aa  594  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.68 
 
 		 388 aa  594  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.39 
 
 		 391 aa  594  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  73.39 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.13 
 
 		 388 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.2 
 
 		 388 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  72.16 
 
 		 388 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  72.42 
 
 		 389 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  70.69 
 
 		 389 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.13 
 
 		 388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.62 
 
 		 388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.39 
 
 		 388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  70.62 
 
 		 388 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  69.85 
 
 		 388 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  69.85 
 
 		 388 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  69.85 
 
 		 388 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  70.1 
 
 		 397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  70.62 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.59 
 
 		 388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  70.1 
 
 		 388 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  69.59 
 
 		 388 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.1 
 
 		 388 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.56 
 
 		 388 aa  569  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  68.56 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.85 
 
 		 388 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  69.07 
 
 		 388 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  67.27 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  67.27 
 
 		 388 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.1 
 
 		 397 aa  545  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  66.75 
 
 		 387 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  66.49 
 
 		 387 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  66.24 
 
 		 387 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.72 
 
 		 387 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.98 
 
 		 409 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.21 
 
 		 409 aa  534  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.98 
 
 		 387 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  65.46 
 
 		 409 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  62.37 
 
 		 388 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.99 
 
 		 398 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.47 
 
 		 391 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  61.79 
 
 		 389 aa  501  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  59.39 
 
 		 397 aa  481  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  57.6 
 
 		 491 aa  480  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.96 
 
 		 388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  52.91 
 
 		 422 aa  418  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.66 
 
 		 372 aa  421  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  48.07 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.07 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  48.07 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  31.09 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.89 
 
 		 451 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.75 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  32.6 
 
 		 440 aa  166  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  32.42 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 		 453 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  32.22 
 
 		 427 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  32.3 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.68 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  33.05 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.02 
 
 		 450 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.02 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.02 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.01 
 
 		 457 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.49 
 
 		 467 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  32.4 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.55 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  32.09 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.46 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  30.68 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  32.03 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  30.62 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.18 
 
 		 467 aa  156  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  32.03 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  31.93 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.46 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.02 
 
 		 437 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  30.49 
 
 		 437 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.86 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  30.66 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  29.2 
 
 		 466 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  32.21 
 
 		 475 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.01 
 
 		 436 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.42 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.89 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.08 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  30.49 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  31.84 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  30.42 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  31.57 
 
 		 442 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  31.3 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>