More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0150 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
372 aa  771    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  57.53 
 
 
388 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  56.18 
 
 
389 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.72 
 
 
389 aa  448  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  56.45 
 
 
388 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.84 
 
 
388 aa  435  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  56.45 
 
 
388 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.72 
 
 
388 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  56.18 
 
 
388 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  56.45 
 
 
388 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  54.57 
 
 
388 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  55.38 
 
 
397 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  55.38 
 
 
388 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  54.84 
 
 
389 aa  432  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.91 
 
 
388 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  54.57 
 
 
391 aa  428  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  54.55 
 
 
390 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.57 
 
 
388 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.11 
 
 
388 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.57 
 
 
388 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.11 
 
 
388 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  53.49 
 
 
388 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.03 
 
 
388 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  54.03 
 
 
388 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.23 
 
 
388 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.76 
 
 
388 aa  421  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  53.23 
 
 
388 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  55.08 
 
 
389 aa  421  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  54.03 
 
 
388 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.66 
 
 
389 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.49 
 
 
388 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.76 
 
 
388 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  51.61 
 
 
388 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.23 
 
 
388 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  53.76 
 
 
388 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  53.23 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.57 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.34 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  53.76 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.94 
 
 
391 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  53.23 
 
 
395 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  53.49 
 
 
388 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.88 
 
 
388 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.15 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.42 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  52.49 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  52.15 
 
 
387 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 
491 aa  403  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  52.42 
 
 
388 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.34 
 
 
409 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.15 
 
 
387 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  51.88 
 
 
409 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.81 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.61 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.19 
 
 
388 aa  380  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  50.4 
 
 
422 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  39.19 
 
 
389 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.19 
 
 
389 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  39.19 
 
 
389 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  32.13 
 
 
453 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.14 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  30.39 
 
 
427 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  30.49 
 
 
431 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  31.85 
 
 
435 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.97 
 
 
426 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.12 
 
 
442 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.19 
 
 
428 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.06 
 
 
473 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.5 
 
 
439 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  29.97 
 
 
440 aa  156  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  29.62 
 
 
446 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.82 
 
 
457 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.15 
 
 
440 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  29.94 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0718  nucleotide sugar dehydrogenase  33.33 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.62 
 
 
446 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.32 
 
 
473 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  29.74 
 
 
473 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.2 
 
 
450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.81 
 
 
438 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.74 
 
 
473 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.96 
 
 
436 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.16 
 
 
447 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  31.21 
 
 
427 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  29.27 
 
 
438 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  29.82 
 
 
470 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  29.61 
 
 
440 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.82 
 
 
470 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.38 
 
 
404 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  29.27 
 
 
434 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.86 
 
 
482 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  28.99 
 
 
449 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  29.82 
 
 
470 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  28.61 
 
 
441 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.35 
 
 
467 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.17 
 
 
442 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5424  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.51 
 
 
429 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  29.54 
 
 
438 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.08 
 
 
440 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  27.99 
 
 
459 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>