More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2850 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  785    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.13 
 
 		 388 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  68.04 
 
 		 388 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  69.33 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.78 
 
 		 388 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  68.3 
 
 		 389 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  67.53 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.53 
 
 		 388 aa  557  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  67.78 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.27 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  67.27 
 
 		 388 aa  551  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.89 
 
 		 391 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  66.24 
 
 		 388 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.01 
 
 		 388 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  66.75 
 
 		 388 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  66.75 
 
 		 388 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  66.49 
 
 		 388 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  66.75 
 
 		 388 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  65.98 
 
 		 388 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  66.49 
 
 		 388 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.98 
 
 		 388 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  65.98 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.24 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.24 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.49 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.98 
 
 		 388 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  66.24 
 
 		 388 aa  543  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.98 
 
 		 388 aa  541  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.66 
 
 		 389 aa  541  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.46 
 
 		 388 aa  542  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  65.98 
 
 		 388 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  63.4 
 
 		 389 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  65.72 
 
 		 409 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  66.24 
 
 		 388 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.46 
 
 		 409 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64.69 
 
 		 409 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  64.86 
 
 		 395 aa  531  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  64.95 
 
 		 387 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.21 
 
 		 387 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.49 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.46 
 
 		 387 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.21 
 
 		 387 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  64.43 
 
 		 388 aa  532  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.4 
 
 		 388 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.59 
 
 		 390 aa  531  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.43 
 
 		 387 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  63.4 
 
 		 388 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  62.37 
 
 		 389 aa  514  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.28 
 
 		 398 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  61.71 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.41 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  59.8 
 
 		 491 aa  487  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  56.92 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.19 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.49 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  52.15 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  45.76 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.76 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  45.76 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.1 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  35.91 
 
 		 457 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  35.26 
 
 		 427 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  32.43 
 
 		 447 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  33.61 
 
 		 449 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  34.28 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.43 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  33.52 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  33.52 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  31.13 
 
 		 466 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.9 
 
 		 478 aa  166  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  31.84 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  31.86 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.15 
 
 		 467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.14 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.4 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  30.83 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.02 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.82 
 
 		 438 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.37 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.02 
 
 		 441 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  32.97 
 
 		 443 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.07 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  31.13 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  31.88 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  31.55 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1810  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.46 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.98 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  33.08 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  32.78 
 
 		 437 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  32.26 
 
 		 470 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  32.22 
 
 		 440 aa  159  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  32.64 
 
 		 449 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  32.57 
 
 		 449 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  32.64 
 
 		 449 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  31.55 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.87 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  31.27 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  32.21 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>