More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3861 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 398 aa  807    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.62 
 
 		 388 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  68.65 
 
 		 388 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  66.84 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  65.55 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.54 
 
 		 388 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.06 
 
 		 388 aa  544  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  67.62 
 
 		 388 aa  542  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.54 
 
 		 388 aa  543  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  65.54 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  65.54 
 
 		 389 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.8 
 
 		 388 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  65.54 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  66.15 
 
 		 389 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  65.54 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.28 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  66.32 
 
 		 388 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  65.54 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.03 
 
 		 388 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  65.03 
 
 		 388 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  65.03 
 
 		 388 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  65.55 
 
 		 390 aa  536  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  65.03 
 
 		 388 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.42 
 
 		 388 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.77 
 
 		 388 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.51 
 
 		 388 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  64.51 
 
 		 388 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.77 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.95 
 
 		 389 aa  530  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  63.73 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.69 
 
 		 388 aa  521  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64.68 
 
 		 409 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  64.42 
 
 		 395 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  65.03 
 
 		 388 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.82 
 
 		 387 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.9 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  63.82 
 
 		 388 aa  518  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  64.16 
 
 		 409 aa  518  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  64.08 
 
 		 388 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  62.86 
 
 		 391 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.38 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.99 
 
 		 389 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  63.9 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64.16 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.9 
 
 		 387 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.27 
 
 		 388 aa  511  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  63.99 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  65.28 
 
 		 388 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.6 
 
 		 387 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  60.15 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  57.53 
 
 		 491 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.88 
 
 		 391 aa  474  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  56.59 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.32 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.57 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  50.38 
 
 		 422 aa  398  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  42.38 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  42.38 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.38 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.64 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  34.38 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  34.73 
 
 		 464 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  31.36 
 
 		 447 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.95 
 
 		 478 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.82 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.51 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  32.39 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.17 
 
 		 434 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.17 
 
 		 434 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.89 
 
 		 404 aa  166  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.52 
 
 		 450 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  34.93 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  32.7 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.52 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.65 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  32.11 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.24 
 
 		 434 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  35.08 
 
 		 434 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  30.96 
 
 		 439 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  32.43 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.9 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.97 
 
 		 467 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  34.44 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  33.79 
 
 		 464 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  34.81 
 
 		 438 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  32.6 
 
 		 427 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  31.52 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  31.42 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.32 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.52 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.96 
 
 		 442 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.71 
 
 		 446 aa  159  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  34.54 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  31.16 
 
 		 437 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.83 
 
 		 438 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  31.16 
 
 		 437 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.4 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  32.51 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.51 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  34.17 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>