More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1202 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.55 
 
 
388 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  89.69 
 
 
388 aa  712    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  78.09 
 
 
388 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  789    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.84 
 
 
388 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  74.74 
 
 
388 aa  621  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  75.52 
 
 
388 aa  623  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  74.94 
 
 
395 aa  618  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  75 
 
 
397 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  74.48 
 
 
388 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.77 
 
 
388 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  74.48 
 
 
388 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75 
 
 
389 aa  615  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  74.48 
 
 
388 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75 
 
 
388 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  75.71 
 
 
391 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  74.23 
 
 
388 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0255325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.23 
 
 
388 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  74.23 
 
 
388 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  74.23 
 
 
388 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  74.74 
 
 
389 aa  611  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.48 
 
 
388 aa  610  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  74.23 
 
 
388 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.97 
 
 
388 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  73.71 
 
 
388 aa  611  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.23 
 
 
388 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.71 
 
 
388 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.23 
 
 
388 aa  610  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.97 
 
 
388 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  74.23 
 
 
388 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  74.48 
 
 
388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.94 
 
 
388 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  72.94 
 
 
388 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  73.45 
 
 
388 aa  594  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  72.68 
 
 
387 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.82 
 
 
390 aa  590  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.42 
 
 
389 aa  589  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  72.16 
 
 
388 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.42 
 
 
387 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  71.91 
 
 
387 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  71.91 
 
 
387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  70.36 
 
 
387 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  70.36 
 
 
388 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.59 
 
 
409 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.07 
 
 
409 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  69.59 
 
 
409 aa  565  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  68.3 
 
 
388 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.75 
 
 
397 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.15 
 
 
398 aa  538  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  64.36 
 
 
389 aa  523  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  63.24 
 
 
491 aa  518  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.4 
 
 
391 aa  518  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  58.94 
 
 
397 aa  491  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.76 
 
 
388 aa  471  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.18 
 
 
372 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  54.41 
 
 
422 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  47.3 
 
 
389 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.3 
 
 
389 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  47.3 
 
 
389 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  34.17 
 
 
437 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  34.17 
 
 
437 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  33.71 
 
 
457 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.75 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.87 
 
 
457 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  30.94 
 
 
466 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.43 
 
 
451 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  33.06 
 
 
427 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  32.64 
 
 
447 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.22 
 
 
451 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.96 
 
 
450 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.58 
 
 
426 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  31.91 
 
 
449 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.51 
 
 
438 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  30.94 
 
 
453 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.85 
 
 
442 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.23 
 
 
446 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  30.92 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  31.2 
 
 
440 aa  167  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  32.16 
 
 
450 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.08 
 
 
460 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  32.97 
 
 
448 aa  166  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  32.24 
 
 
443 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  31.49 
 
 
450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  32.22 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.77 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  31.58 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  30.6 
 
 
459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  31.83 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  31.86 
 
 
473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  32.22 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.78 
 
 
447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.21 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.47 
 
 
440 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  30.64 
 
 
443 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.32 
 
 
440 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.94 
 
 
439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.35 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.44 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  31.87 
 
 
449 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.49 
 
 
446 aa  163  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>