More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1316 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1316  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  228  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000908  transcriptional regulator AsnC family  79.82 
 
 		 126 aa  186  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.499259  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  78.9 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1042  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  62.39 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  62.39 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  57.8 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  58.72 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 172 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  35.85 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  34.86 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  34.29 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  38.38 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 196 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.32 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  34.62 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 181 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4811  transcriptional regulator, AsnC family  33.64 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3448  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0711543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  34.95 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  30.39 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 186 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  37.62 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  35.11 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  28.43 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  33.01 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  31.63 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1442  transcriptional regulator, AsnC family  32.04 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  32.04 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 164 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2104  AsnC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>