More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1042 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1042  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 147 aa  303  7e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  68.49 
 
 		 171 aa  214  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  62.59 
 
 		 167 aa  203  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 150 aa  184  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  55.78 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000908  transcriptional regulator AsnC family  65.87 
 
 		 126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.499259  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 172 aa  168  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1316  AsnC family transcriptional regulator  62.39 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  41.73 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2760  leucine-responsive transcriptional regulator  38.57 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  39.16 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.86 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 177 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.3 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  37.06 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 155 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 155 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  37.06 
 
 		 164 aa  106  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  37.06 
 
 		 164 aa  106  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  37.06 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 181 aa  105  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  37.41 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  105  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  105  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  105  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  36.3 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  34.97 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  34.97 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 159 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.32 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 163 aa  104  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  36.36 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 159 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 181 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  40.32 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  40.32 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 154 aa  103  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>