More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000908 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000908  transcriptional regulator AsnC family  100 
 
 		 126 aa  259  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.499259  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  96.03 
 
 		 171 aa  254  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1316  AsnC family transcriptional regulator  79.82 
 
 		 110 aa  186  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1042  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  65.87 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  61.11 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  39.2 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.4 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  39.84 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4811  transcriptional regulator, AsnC family  39.52 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 181 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  40.65 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  41.23 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 174 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  41.46 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 159 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  41.8 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  36.59 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.21 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  36.59 
 
 		 167 aa  88.6  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 154 aa  88.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  38.21 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  38.98 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  40.16 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  35.83 
 
 		 167 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  43.44 
 
 		 161 aa  87.8  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  36.89 
 
 		 161 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  33.87 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  39.02 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 163 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  36.59 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  38.14 
 
 		 150 aa  87.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 186 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  35.77 
 
 		 167 aa  87.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  38.33 
 
 		 164 aa  87.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 176 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 157 aa  87  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  38.21 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  86.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 197 aa  86.7  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  36.59 
 
 		 158 aa  86.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>