More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1770 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 234 aa  463  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0933094  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  30.61 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.61 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.2 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.2 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.2 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.42 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.2 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.2 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.39 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.38 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.98 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  32.45 
 
 		 278 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.3 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 		 321 aa  99  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 		 276 aa  99  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 		 264 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 280 aa  98.2  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  30.17 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.938804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 		 277 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  35.94 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.8 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  33.15 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 		 262 aa  95.9  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 306 aa  95.9  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 277 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 277 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 		 277 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 274 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 274 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 274 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.132419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 		 280 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 		 277 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0945  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  34.62 
 
 		 304 aa  93.2  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 272 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  32.78 
 
 		 303 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 		 277 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 284 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 293 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 257 aa  92  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 		 284 aa  92  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0875  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  29.05 
 
 		 264 aa  92  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123287 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1192  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  28.89 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  29.46 
 
 		 268 aa  92  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 259 aa  92  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 284 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 284 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 		 277 aa  92  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 		 274 aa  92  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 268 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>