More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0648 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  100 
 
 		 109 aa  217  5e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  56.86 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  60.61 
 
 		 106 aa  120  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  58.33 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  51.02 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  50 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  51.02 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  51.02 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  50 
 
 		 102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  57.58 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  53.06 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  52.94 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  53.61 
 
 		 102 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  55.67 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  52.08 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  56.57 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  57.58 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  52.58 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  53.61 
 
 		 102 aa  114  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  52.08 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  52.58 
 
 		 102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  50 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  48.96 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  51.04 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  45.36 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  52.08 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  52.08 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  50.98 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  39.6 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.35 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  36.73 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  35.71 
 
 		 119 aa  76.6  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  42.67 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  39.39 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  36.54 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  35.58 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0496  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.250229  hitchhiker  0.00000000405496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  34.62 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  36.54 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  35.35 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  38.38 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  35.35 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  35.35 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  35.35 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4508  ribosomal protein S10  35.71 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.815174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3436  ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3759  ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1139  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000305109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  35.35 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1122  30S ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6615  30S ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  37.37 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  37.37 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  35.35 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3025  30S ribosomal protein S10  35.29 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544765  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2908  ribosomal protein S10  33 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0952  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000292109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  32.69 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  35.35 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0594  SSU ribosomal protein S10P  34.34 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000677882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1185  ribosomal protein S10  31.63 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  34 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  34.34 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  34.34 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  36.08 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  34 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0488  30S ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.149423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0318  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.1858999999999998e-21  hitchhiker  0.0000342143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2175  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2156  SSU ribosomal protein S10P  35 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0283637  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  33 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>