More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1169 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  89.11 
 
 
102 aa  184  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  76.24 
 
 
102 aa  168  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  74.76 
 
 
103 aa  167  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  75.25 
 
 
102 aa  167  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  76.24 
 
 
102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  72.28 
 
 
102 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  73.27 
 
 
102 aa  159  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  71.29 
 
 
102 aa  159  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  71.29 
 
 
102 aa  157  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  72.28 
 
 
102 aa  157  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  74.26 
 
 
102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  74.26 
 
 
102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  67 
 
 
104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  58.42 
 
 
102 aa  134  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  57.43 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  56.44 
 
 
102 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  55.45 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  57.43 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  53.47 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  51.49 
 
 
102 aa  122  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  53.12 
 
 
121 aa  120  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  54.55 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  54.55 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  53.54 
 
 
106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 
106 aa  115  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  55.45 
 
 
102 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  51.04 
 
 
109 aa  110  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  37.86 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  37.37 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.37 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  39.6 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  34.34 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  42.57 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  42 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  42.57 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  35.35 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  42 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  42.57 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  42.57 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0883  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808839 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  41 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0663  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1286  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174582  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0477  30S ribosomal protein S10  37 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  39 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  41.58 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  41.58 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1535  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  41.58 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1560  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0613138  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1185  ribosomal protein S10  39.22 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  39 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  41 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  41.58 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  39 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  40 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  41.58 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  41.58 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  40.59 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  40 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16981  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1073  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16871  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19481  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17101  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2023  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.532021  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  40.59 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  41.58 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  41.58 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1599  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  40.59 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  39.6 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  40.59 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  40.59 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  40.59 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16301  30S ribosomal protein S10  37 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  37.86 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  40.59 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  40 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  40.59 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  40.59 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  39 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  37 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  40.4 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  40.4 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  40.4 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  40.4 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  40.4 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  40.4 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0319  30S ribosomal protein S10  36 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717692  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  38 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  39.6 
 
 
102 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  40 
 
 
102 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  40 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23661  30S ribosomal protein S10  37 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.09836 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  38 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  40.4 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>