More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1302 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  99.02 
 
 		 102 aa  206  7e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  98.04 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  92.16 
 
 		 102 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  89.22 
 
 		 102 aa  189  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  58.42 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  59.8 
 
 		 102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  59 
 
 		 102 aa  133  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  56.86 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  59 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  56.86 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  57 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  58 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  51.96 
 
 		 102 aa  128  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  54.9 
 
 		 102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  51.49 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  50.98 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  51.02 
 
 		 109 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  51.96 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  51.96 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  54.08 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  48.48 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  49.49 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  48.48 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  47.47 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  46.39 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  46.46 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  41 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  35.29 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  38 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  38 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1185  ribosomal protein S10  41.24 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3025  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544765  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  38 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000309802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2775  30S ribosomal protein S10  40.4 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0390875  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  37 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1139  30S ribosomal protein S10  37.62 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000305109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  37.37 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  39 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  37.11 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2258  30S ribosomal protein S10  37.37 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323057  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  38 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  37.37 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000557802  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  37.37 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0659  30S ribosomal protein S10  37.37 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000122107  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0952  30S ribosomal protein S10  36.63 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000292109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2908  ribosomal protein S10  34 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3996  ribosomal protein S10  35 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0473  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000156934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_416  ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4277  ribosomal protein S10  36 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000346918  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000442606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>