More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2402 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  184  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000309802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  82.35 
 
 		 102 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  81.37 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  81.37 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 		 102 aa  174  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 		 102 aa  174  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 		 102 aa  174  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 		 102 aa  174  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 		 102 aa  174  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 		 102 aa  174  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 102 aa  173  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 102 aa  173  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 102 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 102 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  81.55 
 
 		 103 aa  172  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1832  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000204136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000523033  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 102 aa  170  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0109  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 102 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000877818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  77.78 
 
 		 103 aa  164  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  76.7 
 
 		 103 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0594  SSU ribosomal protein S10P  75.49 
 
 		 102 aa  163  9e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000677882  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  161  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  73.74 
 
 		 103 aa  160  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  160  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  157  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  156  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  156  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000442606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  69.7 
 
 		 106 aa  153  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  69.61 
 
 		 107 aa  153  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  68.63 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  68.63 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  67.65 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1575  ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000000735097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1139  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000305109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  64.36 
 
 		 103 aa  149  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  66.67 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3759  ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3436  ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1122  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 101 aa  148  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6615  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0952  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  146  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000292109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4508  ribosomal protein S10  65.35 
 
 		 101 aa  146  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.815174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3668  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 105 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  144  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  62.75 
 
 		 103 aa  143  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 105 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 103 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  64.76 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1286  30S ribosomal protein S10  63.81 
 
 		 105 aa  140  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0663  30S ribosomal protein S10  63.81 
 
 		 105 aa  140  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>