More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51291 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  100 
 
 
121 aa  246  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  79.41 
 
 
125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  68 
 
 
119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  58.77 
 
 
119 aa  141  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  60.17 
 
 
115 aa  134  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  40.59 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  37.62 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  36.27 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  39.6 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  36.27 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  37 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  37.86 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  36.63 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  36.27 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  39 
 
 
102 aa  84.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  39.8 
 
 
102 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  35.64 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  37 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  36.27 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  36.27 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  37 
 
 
102 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  35.29 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  34.65 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  43.42 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  43.42 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  35.71 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  35.71 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  34.69 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  34.02 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  34.69 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  31.25 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  36.08 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0488  30S ribosomal protein S10  34.02 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.149423  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  32.47 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1419  ribosomal protein S10  36 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  31.31 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0659  30S ribosomal protein S10  32.32 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000122107  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0496  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.250229  hitchhiker  0.00000000405496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2258  30S ribosomal protein S10  32.32 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  32.32 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000557802  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  31 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  32.32 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  40.91 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2327  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000187948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2620  30S ribosomal protein S10  30.3 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0089827  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2236  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000196356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2775  30S ribosomal protein S10  29.29 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0390875  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0033  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0058  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0227  ribosomal protein S10  30.69 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30445  Plastid ribosomal protein S10 small ribosomal subunit  30.3 
 
 
136 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.499456  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2908  ribosomal protein S10  28.87 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440082  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  28.87 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  28 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0766  30S ribosomal protein S10  29.59 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000754172  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2082  30S ribosomal protein S10  31.31 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000364136  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1876  30S ribosomal protein S10  31.31 
 
 
103 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.000570369  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0002  30S ribosomal protein S10  31.31 
 
 
103 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000572155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  30.39 
 
 
106 aa  50.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  31 
 
 
102 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0083  30S ribosomal protein S10  31.31 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000583291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  28.28 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1969  ribosomal protein S10  31.31 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000960204  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0265  ribosomal protein S10  28.71 
 
 
103 aa  49.7  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.00000000000599557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  28.71 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1185  ribosomal protein S10  28.57 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0450  30S ribosomal protein S10  30 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000251072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  26.53 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  26.53 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  28.71 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  28.71 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  28.71 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  26.53 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  26.53 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0319  30S ribosomal protein S10  28.71 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1575  ribosomal protein S10  30.69 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000000735097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0473  30S ribosomal protein S10  29 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000156934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  27 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_416  ribosomal protein S10  29 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0468  30S ribosomal protein S10  28.71 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000173961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  31 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  30 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  29 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  27.72 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  29 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00444  30S ribosomal protein S10  28.71 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0405184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  31 
 
 
103 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2175  30S ribosomal protein S10  28.71 
 
 
103 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2373  30S ribosomal protein S10  28.71 
 
 
103 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.837203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  27.72 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  28.57 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  27.72 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  27.72 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  31 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  27.72 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  29 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  27 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  28.71 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.0000321241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  27.72 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>