More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1186 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  99.02 
 
 		 102 aa  203  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3025  30S ribosomal protein S10  97.06 
 
 		 102 aa  199  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544765  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  82.35 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0450  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000251072  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0473  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000156934  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_416  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  153  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  67.65 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  150  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  150  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  149  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  148  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  147  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  147  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  147  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  63.73 
 
 		 107 aa  147  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  147  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  147  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  147  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  147  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  64.71 
 
 		 103 aa  147  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  66.02 
 
 		 103 aa  147  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  147  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4914  ribosomal protein S10  90.91 
 
 		 77 aa  146  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0255931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  69 
 
 		 103 aa  146  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 104 aa  146  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  146  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 		 104 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  62.75 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0755  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000508535  normal  0.0162488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  64.36 
 
 		 103 aa  144  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0457  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 		 104 aa  143  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>