More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0304 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  100 
 
 		 106 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  95.28 
 
 		 106 aa  205  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  94.34 
 
 		 106 aa  203  5e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  93.4 
 
 		 106 aa  201  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  64 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  53.54 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  57.58 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  49.49 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  51.52 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  53.06 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  48.48 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  53.54 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  46.46 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  46.46 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  46.46 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  46.46 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  44.44 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  49.49 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  45.45 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  47.47 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  47.47 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  42.27 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  49.49 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0292  30S ribosomal protein S10  42.86 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0377689  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  34.34 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  43.14 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  34.69 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  39.81 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  41.18 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  40.57 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  39.6 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  34.69 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  35.71 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  42.16 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  39.6 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  39.42 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  39.6 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  39.62 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  41.18 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  39.22 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  41.18 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2908  ribosomal protein S10  39 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  39.42 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  39.22 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  33.66 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  37.5 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  39.22 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  37.5 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  40.2 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  35.58 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  37.5 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  37.5 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  37.5 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  40.2 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0594  SSU ribosomal protein S10P  38.24 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000677882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  39.22 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  39.62 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  66.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  40 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1339  ribosomal protein S10  37.38 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2325  30S ribosomal protein S10  37.5 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00118497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0294  ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000065146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  38.24 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  37.62 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  38.24 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1868  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0207865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  38.24 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  36.27 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  38.68 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000523033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  36.63 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000267319  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000277123  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>