More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4006 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  87.13 
 
 		 101 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  87.13 
 
 		 101 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  87.13 
 
 		 101 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  87.13 
 
 		 101 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 		 102 aa  174  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 102 aa  174  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  83.17 
 
 		 102 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 102 aa  174  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 102 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 102 aa  173  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 103 aa  173  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  80.2 
 
 		 102 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  80.2 
 
 		 101 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  84.54 
 
 		 123 aa  168  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  75.25 
 
 		 103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 102 aa  157  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  76.24 
 
 		 104 aa  157  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 102 aa  157  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 102 aa  156  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  72.28 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  75.25 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  73.27 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  73.27 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  73.27 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  73.27 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  73.27 
 
 		 102 aa  154  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  73.27 
 
 		 102 aa  154  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  73.27 
 
 		 102 aa  154  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  72.28 
 
 		 102 aa  153  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  70.3 
 
 		 102 aa  153  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 		 102 aa  153  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0496  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 		 102 aa  153  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.250229  hitchhiker  0.00000000405496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  70.3 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 		 104 aa  152  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 103 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  71.29 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  73.27 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  72.28 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  71.29 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  70.3 
 
 		 103 aa  150  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  72.28 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 103 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 103 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  71.13 
 
 		 107 aa  150  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  150  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2373  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 103 aa  150  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.837203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 102 aa  150  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  70.3 
 
 		 105 aa  149  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1354  30S ribosomal protein S10  70.3 
 
 		 103 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.546745  normal  0.0408576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  71 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  71.13 
 
 		 104 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  68 
 
 		 103 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.0000321241 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1248  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  73.2 
 
 		 103 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 103 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3025  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544765  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 102 aa  147  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00444  30S ribosomal protein S10  69 
 
 		 103 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0405184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  68.32 
 
 		 103 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  71.29 
 
 		 105 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0468  30S ribosomal protein S10  68 
 
 		 103 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000173961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0659  30S ribosomal protein S10  70.3 
 
 		 105 aa  147  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000122107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 103 aa  147  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 103 aa  147  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0425  30S ribosomal protein S10  67 
 
 		 103 aa  147  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000101436  hitchhiker  0.0000276478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  72.16 
 
 		 108 aa  147  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 103 aa  147  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 103 aa  147  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4545  ribosomal protein S10  68 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000155488  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  66 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 102 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  69 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3745  30S ribosomal protein S10  68 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00135486  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  67 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3637  30S ribosomal protein S10  68 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000584006  normal  0.459498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3710  ribosomal protein S10  68 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000120586  normal  0.692874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>