More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2236 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2236  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
126 aa  255  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000196356  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2327  30S ribosomal protein S10  98.21 
 
 
112 aa  223  7e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000187948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0058  30S ribosomal protein S10  98.02 
 
 
103 aa  202  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317741  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0033  30S ribosomal protein S10  98.02 
 
 
103 aa  202  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0083  30S ribosomal protein S10  95.05 
 
 
103 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000583291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0002  30S ribosomal protein S10  95.05 
 
 
103 aa  198  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000572155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1876  30S ribosomal protein S10  95.05 
 
 
103 aa  198  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.000570369  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2082  30S ribosomal protein S10  94.06 
 
 
103 aa  197  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000364136  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1969  ribosomal protein S10  86.14 
 
 
103 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000960204  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0285  30S ribosomal protein S10  80.2 
 
 
103 aa  176  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00476788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  62.24 
 
 
103 aa  144  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  62.38 
 
 
104 aa  135  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 
102 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 
102 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 
102 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 
102 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 
102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 
102 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  133  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  59 
 
 
103 aa  133  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  60.2 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  131  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
103 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  130  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  130  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 
101 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 
101 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 
101 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 
101 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  130  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  130  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0198  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  130  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000200655  unclonable  0.0000000000157318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0193  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  130  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000424599  decreased coverage  0.00027939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  130  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000267319  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0322  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000012719  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3710  ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000120586  normal  0.692874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3823  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000546327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0755  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000508535  normal  0.0162488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0199  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000181945  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4002  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000661379  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3637  ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000269105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  56.12 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0282  ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000746506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0195  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000645818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3745  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00135486  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0404  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0007092  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3808  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000064612  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4057  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000379961  hitchhiker  0.000000000138432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0583  ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572032  normal  0.180599 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0058  SSU ribosomal protein S10P  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000415336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0147  ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000495355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3760  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000001631  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3916  ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.06232e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4171  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000385608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4545  ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000155488  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.0000321241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3637  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000584006  normal  0.459498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3910  30S ribosomal protein S10  58.76 
 
 
103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00375138  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3752  SSU ribosomal protein S10P  56.7 
 
 
103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000621266  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06240  30S ribosomal protein S10  58.76 
 
 
103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00394017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000277123  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03172  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00056658  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0392  ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
105 aa  128  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03123  hypothetical protein  57.73 
 
 
103 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000601511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3515  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000492299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0392  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000144875  hitchhiker  0.00689004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3804  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3616  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387491  hitchhiker  0.00493043 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0169  30S ribosomal protein S10  56.7 
 
 
103 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000585443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3706  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
103 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000100932  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  57.73 
 
 
106 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>