More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2258 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2258  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000557802  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  99.05 
 
 
105 aa  213  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0659  30S ribosomal protein S10  97.14 
 
 
105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000122107  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  88.57 
 
 
105 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2775  30S ribosomal protein S10  86.27 
 
 
102 aa  186  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0390875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
103 aa  155  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  74.26 
 
 
123 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  72.28 
 
 
101 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  75 
 
 
102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  75 
 
 
102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  75.26 
 
 
102 aa  150  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  150  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  150  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  150  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  149  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  75.26 
 
 
102 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  74.23 
 
 
102 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  73 
 
 
102 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  74.23 
 
 
102 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  73 
 
 
102 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  74.23 
 
 
102 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  148  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  147  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  73.47 
 
 
101 aa  148  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 
102 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  73.2 
 
 
102 aa  146  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  73.2 
 
 
102 aa  146  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  70.3 
 
 
102 aa  146  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  146  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1354  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
103 aa  144  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.546745  normal  0.0408576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  73.2 
 
 
102 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  143  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0496  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  143  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.250229  hitchhiker  0.00000000405496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  72.16 
 
 
104 aa  143  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 
104 aa  142  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  67.65 
 
 
103 aa  142  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
104 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
103 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0305  ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  140  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.33988  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
103 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  140  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  140  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  62.5 
 
 
108 aa  139  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1248  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  68 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 
104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0227  ribosomal protein S10  64.29 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>