More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30430 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 
125 aa  257  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  74.14 
 
 
119 aa  177  4.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  71.9 
 
 
121 aa  176  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  63.21 
 
 
119 aa  141  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  64.36 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  40 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  38 
 
 
104 aa  84  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  35.29 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  38 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  39 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  36.27 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  35.35 
 
 
109 aa  82  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  37.86 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  38 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  38 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  37 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  38.61 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  38 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  34.38 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  37.37 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  37 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  34.34 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  37 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  34.34 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  33.33 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  37 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  37 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  33.33 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  33.67 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  40.79 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  40.79 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  35.71 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0033  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0488  30S ribosomal protein S10  32.99 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.149423  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0058  30S ribosomal protein S10  35.35 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317741  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2327  30S ribosomal protein S10  34.65 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000187948  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  33.01 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2258  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323057  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0496  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.250229  hitchhiker  0.00000000405496 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000557802  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1419  ribosomal protein S10  37.11 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2236  30S ribosomal protein S10  34.65 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000196356  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0659  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
105 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000122107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1876  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.000570369  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30445  Plastid ribosomal protein S10 small ribosomal subunit  32.32 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.499456  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0002  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000572155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2082  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000364136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  33.33 
 
 
103 aa  60.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0319  30S ribosomal protein S10  32.35 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  32.35 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  32.35 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2775  30S ribosomal protein S10  31.31 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0390875  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0083  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000583291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  31.37 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1969  ribosomal protein S10  34.34 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000960204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  32.35 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  31.37 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0191  ribosomal protein S10  34.74 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0227  ribosomal protein S10  31 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2908  ribosomal protein S10  30.39 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440082  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2175  30S ribosomal protein S10  32.35 
 
 
103 aa  58.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0766  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000754172  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  32.35 
 
 
102 aa  57.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  31 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2620  30S ribosomal protein S10  29.41 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0089827  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00729  30S ribosomal protein S10  32.35 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  32 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  32 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  32 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001743  SSU ribosomal protein S10p (S20e)  32.35 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000127695  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  32 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  32 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  31.37 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  30.38 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  30 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  33.98 
 
 
106 aa  57  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  31.96 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  30.39 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  30.3 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  30 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  29.41 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  30.39 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  30.39 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.0000321241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  32.65 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  29.41 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  29.41 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  31.63 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  29.41 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  32.65 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>