More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0810 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  100 
 
 		 102 aa  206  9e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  96.04 
 
 		 103 aa  196  9e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  90.2 
 
 		 102 aa  191  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  93.14 
 
 		 102 aa  176  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  93.14 
 
 		 102 aa  176  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  76.24 
 
 		 103 aa  168  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  74.51 
 
 		 102 aa  166  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  75.25 
 
 		 102 aa  164  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  72.28 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  72.28 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  69.61 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  71.29 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  68.32 
 
 		 102 aa  153  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  63.37 
 
 		 104 aa  144  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  55 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  51.96 
 
 		 102 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  51.96 
 
 		 102 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  50.98 
 
 		 102 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  51 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  53.54 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  51.52 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  51.55 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 106 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  49.49 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  48.96 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  53.06 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  36.27 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  38 
 
 		 115 aa  85.5  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.27 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  35 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  32 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  40 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1185  ribosomal protein S10  39.18 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2908  ribosomal protein S10  35.35 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  39 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  39 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  39 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  40 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  39 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  34.65 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  35.79 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0883  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4508  ribosomal protein S10  38.78 
 
 		 101 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.815174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2620  30S ribosomal protein S10  34.34 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0089827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  34.65 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16301  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0477  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  35.64 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  35.64 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000309802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1122  30S ribosomal protein S10  37.76 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19481  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1073  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1286  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2023  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.532021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0663  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  34.69 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1868  30S ribosomal protein S10  34.02 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0207865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  37.76 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1139  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000305109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>