More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1554 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 102 aa  176  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 102 aa  176  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 101 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 101 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 101 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  83.33 
 
 		 102 aa  174  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 101 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  82.35 
 
 		 102 aa  173  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 102 aa  173  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  82.35 
 
 		 102 aa  173  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  78.64 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 102 aa  168  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  77.45 
 
 		 104 aa  166  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  78 
 
 		 101 aa  165  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  164  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  164  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 123 aa  163  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  163  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  163  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  163  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  163  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  161  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00444  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  161  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0405184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0468  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000173961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3525  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  160  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.0000321241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  160  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3808  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000064612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0322  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000012719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0583  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572032  normal  0.180599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0282  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000746506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3916  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.06232e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3637  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000584006  normal  0.459498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0404  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0007092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3710  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000120586  normal  0.692874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  71.84 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3823  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000546327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0058  SSU ribosomal protein S10P  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000415336  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0147  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000495355  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3745  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00135486  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4545  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000155488  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3637  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000269105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4002  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000661379  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3752  SSU ribosomal protein S10P  70.59 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000621266  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0319  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  73.53 
 
 		 107 aa  158  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 105 aa  157  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001743  SSU ribosomal protein S10p (S20e)  72.55 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000127695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 105 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0198  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000200655  unclonable  0.0000000000157318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0193  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000424599  decreased coverage  0.00027939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00729  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000267319  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  70.87 
 
 		 104 aa  157  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0169  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  157  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000585443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  157  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0659  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 105 aa  156  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000122107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3760  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000001631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4057  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000379961  hitchhiker  0.000000000138432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0199  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000181945  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4171  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000385608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>