More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0354 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  100 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  95.28 
 
 		 106 aa  204  2e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  93.4 
 
 		 106 aa  201  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  92.45 
 
 		 106 aa  200  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  65 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  55.56 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  60.61 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  54.55 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  53.54 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  51.52 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  53.06 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  49.49 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  49.49 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  47.47 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  49.49 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  51.52 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  51.52 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  48.48 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  49.49 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  49.49 
 
 		 102 aa  103  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  50.51 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  46.46 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  50.51 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  44.79 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  45.1 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  36.73 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0292  30S ribosomal protein S10  41.9 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0377689  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  33.33 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  40.74 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  41.58 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  40.38 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  35.71 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  41.18 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  40.2 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  40.57 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  39.42 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  40.2 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  41.18 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  37.5 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  34.69 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  33.67 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  40.2 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  40.38 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  40.2 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  36.54 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2908  ribosomal protein S10  39 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  40.2 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  40.2 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  40.2 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  39.62 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000442606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  39.62 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  39.22 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  36.54 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  36.54 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  36.54 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  40.2 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1868  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0207865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  41 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3025  30S ribosomal protein S10  39.05 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544765  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2325  30S ribosomal protein S10  38.46 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00118497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1139  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000305109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  39.62 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  39.62 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  38.68 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  38.68 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  38.68 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  38.68 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  37.25 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  38.68 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  38.68 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  38.68 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  36.27 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0952  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000292109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  38.68 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  38.68 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  38.24 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  35.29 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  35.29 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  40 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000277123  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>