More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16250 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  96.08 
 
 		 102 aa  202  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  96.08 
 
 		 102 aa  202  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  85.29 
 
 		 102 aa  185  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  80 
 
 		 102 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  168  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  167  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  167  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  167  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  166  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  75 
 
 		 102 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  164  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  74.76 
 
 		 103 aa  161  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  76 
 
 		 102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  76 
 
 		 102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 102 aa  160  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  160  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 102 aa  160  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  159  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  159  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  70.3 
 
 		 123 aa  158  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  73.79 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  156  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  73 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  72 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  69.61 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  71 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  69.61 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4508  ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 101 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.815174  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1122  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 101 aa  153  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  153  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  69.61 
 
 		 102 aa  153  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  153  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  153  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  71 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  72 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3759  ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6615  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3436  ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  68.32 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  151  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  151  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000309802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0109  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000877818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  150  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  71.13 
 
 		 102 aa  150  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 101 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 101 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 101 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 101 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  149  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  65 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  65 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1339  ribosomal protein S10  68.93 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  65 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  66 
 
 		 105 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  66 
 
 		 103 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  66 
 
 		 103 aa  148  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  66 
 
 		 103 aa  147  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000204136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>