More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2620 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2620  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0089827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2908  ribosomal protein S10  86.54 
 
 		 105 aa  184  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1868  30S ribosomal protein S10  80.58 
 
 		 107 aa  173  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0207865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  67.35 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  67.35 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  69.39 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  140  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0594  SSU ribosomal protein S10P  63.27 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000677882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 102 aa  137  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 103 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 102 aa  135  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  135  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  65.31 
 
 		 102 aa  135  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1185  ribosomal protein S10  62.89 
 
 		 101 aa  136  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  65.31 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  65.31 
 
 		 102 aa  136  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  65.31 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0473  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000156934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 102 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_416  ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 103 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 		 103 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0450  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000251072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  133  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 103 aa  133  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1832  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000860395  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000204136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2156  SSU ribosomal protein S10P  62.89 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0283637  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000523033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0109  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000877818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3436  ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6615  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3759  ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1575  ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  130  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000000735097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  130  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1122  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  130  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 101 aa  130  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 103 aa  130  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1339  ribosomal protein S10  60.61 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 103 aa  130  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 		 102 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  61.22 
 
 		 102 aa  130  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  129  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  130  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  129  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>