More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1419 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1419  ribosomal protein S10  100 
 
 
117 aa  233  5.0000000000000005e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
103 aa  148  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  67.33 
 
 
108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  65.35 
 
 
102 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 
102 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  64.08 
 
 
123 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  67.35 
 
 
102 aa  140  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  69.07 
 
 
101 aa  141  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  140  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 
101 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 
101 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
102 aa  140  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  67.35 
 
 
102 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 
101 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 
101 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0659  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 
105 aa  140  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000122107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  140  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  140  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 
105 aa  140  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  67.35 
 
 
102 aa  139  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  67.35 
 
 
102 aa  139  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  65.31 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
104 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
104 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2258  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000557802  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  60.78 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
105 aa  138  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  64.36 
 
 
104 aa  138  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
102 aa  137  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 
102 aa  138  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
102 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
102 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  136  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  136  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  137  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  136  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  64.65 
 
 
103 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
104 aa  136  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
104 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
104 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  63.37 
 
 
102 aa  136  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
103 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  64.36 
 
 
102 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
102 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 
102 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
103 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  61.39 
 
 
103 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0488  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000350893  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  61.39 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>