More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0625 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  99.02 
 
 		 102 aa  205  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  96.08 
 
 		 102 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  96.08 
 
 		 102 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  94.12 
 
 		 102 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  92.16 
 
 		 102 aa  192  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  93.14 
 
 		 102 aa  192  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 		 101 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 		 101 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 		 101 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  85.15 
 
 		 101 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  84.31 
 
 		 103 aa  176  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 102 aa  173  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  82.65 
 
 		 123 aa  173  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  81.37 
 
 		 103 aa  172  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  80 
 
 		 101 aa  168  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 		 102 aa  166  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  80.39 
 
 		 104 aa  166  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  79.41 
 
 		 102 aa  164  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1248  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  161  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  78 
 
 		 103 aa  160  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1354  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.546745  normal  0.0408576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  160  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  75 
 
 		 107 aa  160  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  159  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  77 
 
 		 106 aa  159  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  157  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  72.55 
 
 		 102 aa  157  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  157  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0468  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000173961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  157  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2535  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0360  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1715  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.380329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  156  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00444  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  156  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0405184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  156  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  156  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  156  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  156  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 104 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  75.76 
 
 		 104 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  72.55 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0874  ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>