More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0582 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0582  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  99 
 
 		 102 aa  203  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  98 
 
 		 104 aa  200  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  95.19 
 
 		 106 aa  199  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0360  30S ribosomal protein S10  95 
 
 		 102 aa  196  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1715  30S ribosomal protein S10  95 
 
 		 102 aa  196  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2535  30S ribosomal protein S10  95 
 
 		 102 aa  196  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  88 
 
 		 102 aa  181  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  87 
 
 		 102 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  87 
 
 		 102 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  87 
 
 		 102 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  87 
 
 		 102 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  87 
 
 		 102 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  87 
 
 		 102 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  87 
 
 		 102 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  87 
 
 		 102 aa  180  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  86.87 
 
 		 104 aa  179  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  86 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  85 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  86 
 
 		 102 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  86 
 
 		 102 aa  178  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  86 
 
 		 102 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  84 
 
 		 102 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  84 
 
 		 102 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  85.86 
 
 		 102 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  84 
 
 		 102 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  84 
 
 		 102 aa  177  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  84 
 
 		 102 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  83 
 
 		 102 aa  176  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  83 
 
 		 102 aa  176  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  83 
 
 		 102 aa  176  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  83 
 
 		 102 aa  176  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  83 
 
 		 102 aa  176  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  82 
 
 		 102 aa  176  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  85 
 
 		 102 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  82 
 
 		 102 aa  176  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  85 
 
 		 102 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  86.87 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  82 
 
 		 102 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  79 
 
 		 103 aa  168  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  77.67 
 
 		 103 aa  169  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1354  30S ribosomal protein S10  79 
 
 		 103 aa  167  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.546745  normal  0.0408576 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  78.79 
 
 		 101 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  78.79 
 
 		 101 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  78.79 
 
 		 101 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  78.79 
 
 		 101 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0718  30S ribosomal protein S10  79 
 
 		 103 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000141431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  79 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  78 
 
 		 102 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  78 
 
 		 102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  77 
 
 		 102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  78 
 
 		 102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00729  30S ribosomal protein S10  76 
 
 		 103 aa  160  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001743  SSU ribosomal protein S10p (S20e)  76 
 
 		 103 aa  160  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000127695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4277  ribosomal protein S10  76 
 
 		 103 aa  160  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000346918  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1248  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  159  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  76 
 
 		 102 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2325  30S ribosomal protein S10  73.79 
 
 		 104 aa  158  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00118497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  76 
 
 		 102 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  71.84 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2175  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032436  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0625  ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000466292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4549  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000213954  normal  0.0597614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  72.82 
 
 		 104 aa  157  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 102 aa  156  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  75 
 
 		 103 aa  157  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0453  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0704355  unclonable  0.000000189493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4750  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000671466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0319  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5080  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793453  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0294  ribosomal protein S10  73 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000065146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0486  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000131122  normal  0.0380301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 102 aa  156  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0483  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000151275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  74.75 
 
 		 103 aa  156  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0959  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  156  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000233604  unclonable  0.00000000572443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0755  30S ribosomal protein S10  75.76 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000508535  normal  0.0162488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 102 aa  155  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  70.87 
 
 		 104 aa  155  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0836  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0236552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08840  30S ribosomal protein S10  75 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000352676  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3637  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000584006  normal  0.459498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3910  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00375138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  70.87 
 
 		 104 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  70.87 
 
 		 104 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0583  ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572032  normal  0.180599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3916  ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.06232e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  74 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>