110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2937 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 274 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  34.47 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  34.7 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  30.6 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  35.89 
 
 		 278 aa  99.4  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 275 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 275 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 285 aa  95.5  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  32.05 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  35.44 
 
 		 290 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  31.74 
 
 		 300 aa  90.1  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 275 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 281 aa  85.5  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 315 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 544 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 545 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13056  hypothetical protein  31.86 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  31.6 
 
 		 550 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 556 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  28.34 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  31.44 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  28.34 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  29.58 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 		 556 aa  71.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  28.86 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  36.03 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 426 aa  65.1  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 559 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  34.31 
 
 		 566 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  26.04 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  26.67 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 500 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  28.27 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  27.96 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 497 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3980  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 484 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  27.65 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_6789  predicted protein  37.18 
 
 		 132 aa  48.5  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  26.88 
 
 		 398 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  41.79 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  37.5 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 178 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3396  NUDIX hydrolase  24.44 
 
 		 303 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  46.43 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3177  NUDIX hydrolase  24.47 
 
 		 303 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334234 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  36.47 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.11 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  25.56 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  36.23 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1430  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 355 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.808509  normal  0.524901 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>