92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2354 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 264 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  87.5 
 
 		 264 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  79.17 
 
 		 263 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  67.56 
 
 		 267 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 545 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  35.74 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  38.8 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  38.08 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  37.74 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  40.08 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  34.52 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13056  hypothetical protein  38.71 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 550 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 315 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  34.57 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  36.29 
 
 		 557 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  36.75 
 
 		 556 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  31.84 
 
 		 566 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 		 544 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 368 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  35.53 
 
 		 562 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 426 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  30.8 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  32.02 
 
 		 566 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 		 556 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 		 568 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  35.56 
 
 		 559 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  35.32 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 568 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  36.27 
 
 		 290 aa  98.6  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  32.13 
 
 		 297 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  28.63 
 
 		 222 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3177  NUDIX hydrolase  32.07 
 
 		 303 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3396  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 303 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  32.59 
 
 		 300 aa  86.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  28.34 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  31.88 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  32.66 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 497 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  26.46 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  32.7 
 
 		 398 aa  68.9  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18290  putative hydrolase, NUDIX family domain protein  33.14 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  33 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  31.33 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  31.33 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  29.48 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1280  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0919389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>