85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1280 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1280  NUDIX hydrolase  100 
 
 
226 aa  447  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0919389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 
248 aa  175  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  54.73 
 
 
255 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  49.75 
 
 
251 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  44.05 
 
 
251 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  48.83 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  44.98 
 
 
238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 
246 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  45.77 
 
 
256 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  44.67 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 
257 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  44.5 
 
 
244 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  44.28 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  43.37 
 
 
243 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  43.37 
 
 
243 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2416  NUDIX hydrolase  47.47 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00201354  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  41.63 
 
 
242 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3538  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  45.79 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 
248 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  42.93 
 
 
222 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 
228 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3980  NUDIX hydrolase  46.6 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301883  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  42.78 
 
 
238 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  42.78 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
545 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  34.48 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  32.89 
 
 
313 aa  65.1  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  35.71 
 
 
300 aa  62  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
297 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  31.8 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 
556 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
315 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  33.15 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
285 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 
264 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  37.86 
 
 
550 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
263 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
426 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  29.95 
 
 
281 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
289 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  29.29 
 
 
267 aa  55.1  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
568 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
568 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
278 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  31.44 
 
 
290 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
544 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 
275 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 
275 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 
275 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  28.29 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  40.23 
 
 
562 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
294 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  29.26 
 
 
264 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 
279 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  29.29 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 
556 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 
273 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 
559 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 
368 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100097 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  24.85 
 
 
398 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 
297 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
557 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>