77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0929 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  41.52 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  40.43 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  42.92 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  40 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  37.92 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 242 aa  124  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  38.25 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2416  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00201354  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  37.05 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3538  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 		 251 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1280  NUDIX hydrolase  42.78 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0919389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3980  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  31.84 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 545 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  30.85 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  27.03 
 
 		 566 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  29.32 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 294 aa  52.4  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 285 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  29.95 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  27.49 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 		 556 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 368 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  30.06 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  32.1 
 
 		 550 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 290 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 556 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 544 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 		 215 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 426 aa  41.6  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 		 568 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  29.53 
 
 		 562 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>