96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4283 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 315 aa  617  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  55.76 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  49.07 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 		 275 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  47.12 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 264 aa  205  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  46.94 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  45.39 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  47.02 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  45.15 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  47.02 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  49.14 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  45.49 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 275 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 275 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  40.81 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13056  hypothetical protein  41.98 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 278 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  40.27 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  38.35 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  38.4 
 
 		 545 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  42.99 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  35.32 
 
 		 264 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  38.93 
 
 		 556 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 544 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  38.11 
 
 		 550 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  39 
 
 		 557 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 		 559 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  36.57 
 
 		 556 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  36.95 
 
 		 562 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 		 568 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 		 568 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  36.57 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3177  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334234 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  32.61 
 
 		 566 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  29.96 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3396  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  30.43 
 
 		 566 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  32.51 
 
 		 254 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 281 aa  92.8  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 426 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  38.18 
 
 		 500 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 		 497 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 235 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  30.8 
 
 		 227 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 		 497 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  29.18 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  32.49 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 484 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18290  putative hydrolase, NUDIX family domain protein  33.5 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260549  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  32.81 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  33.9 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  28.93 
 
 		 243 aa  52.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  28.93 
 
 		 243 aa  52.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 249 aa  52.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 242 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  31.7 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  27.31 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  31.7 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  33.98 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 216 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>