78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2822 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  59.56 
 
 		 242 aa  251  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  57.59 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  55.36 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  57.59 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  58.48 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3980  NUDIX hydrolase  53.51 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  47 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  39.29 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  43.72 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 248 aa  134  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  38.84 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  39.91 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  41.63 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  39.91 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1280  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0919389 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  41.4 
 
 		 251 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  39.15 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2416  NUDIX hydrolase  40.93 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00201354  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3538  NUDIX hydrolase  40.93 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  33.33 
 
 		 281 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 274 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  36.57 
 
 		 566 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  41.84 
 
 		 568 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  32.44 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  41.84 
 
 		 568 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  38.51 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  34.95 
 
 		 550 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  28.8 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  30.41 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 264 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 		 556 aa  51.6  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  32.75 
 
 		 290 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  28.24 
 
 		 566 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  28.88 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 		 544 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 557 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 368 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 559 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  29.21 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  29.74 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  28.28 
 
 		 313 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>