75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2180 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  59.56 
 
 		 225 aa  251  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  58.04 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  59.23 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  57.85 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3980  NUDIX hydrolase  52.19 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 244 aa  158  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  43.15 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  42.18 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  40.19 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  40.93 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  40.09 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 248 aa  124  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  35.84 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  38.31 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3538  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 251 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2416  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00201354  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1280  NUDIX hydrolase  41.63 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0919389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  37.26 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  35.55 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 545 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  31.96 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 274 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  41.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  31.21 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  30.65 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 315 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 556 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 290 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 426 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  32.07 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  35.48 
 
 		 550 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 278 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 281 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 568 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 272 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 568 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  31.76 
 
 		 566 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  34.41 
 
 		 544 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  28.85 
 
 		 500 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>